在十九世紀時，第一世多竺千仁波切將他的大弟子，大班智達仙槃他怡(生於一八○○年)，派往竹慶聖地；就在這裡，仙槃他怡在淨境中觀見大圓滿的大瑜伽士吉祥獅子。為了表示對吉祥獅子的崇敬與紀念，仙槃他怡不久之後就創建了大圓滿吉祥獅子五明佛法大學。

大學裡講授的主要課程是大、小五明。大五明是：工巧明、醫方明、聲明、因明
、佛法的內明。小五明則是：詩學、辭學、韻學、戲劇學、占星學。

大學的宗旨向來是推廣悲智雙運的大圓滿的精神，加持學子心靈，培養人天導師
，延續大圓滿傳承。因為大圓滿傳承的加持，大學造就了眾多傑出的修行人，如聲名卓著的堪欽貝瑪札西、巴珠仁波切( 一八○八年至一八八七年)、堪欽貝瑪多傑、大班智達米龐仁波切(一八四六年至一八九一年)、鄔金丹增諾布、以及嘉宮堪布仙噶仁波切(一八七一年至一九二七年)。其中嘉宮堪布仙噶仁波切為十三冊佛典所著之解說頗負盛譽，廣為寧瑪、噶舉、薩迦等派採用。

其他的碩學大德還包括堪布昆保(一八七二年至一九四三年)、堪布雅瓊(一八七九年至一九四一年)、堪布圖嚘、博巴土庫、阿部拉康、堪布圖登年照、以及堪布 貝瑪才望等。還有許多其他歷代大德成為大班智達或大成就者
，或現證虹光身。此外，還有數萬名各藏傳教派的學僧曾來大圓滿吉祥獅子五明佛法大學深造。